1. สามารถใช้เป็นยา ยาฆ่าแมลง สีย้อม และตัวกลางการสังเคราะห์สารอินทรีย์อื่นๆ สามารถใช้ในการสังเคราะห์ 2-aminopyrimidine, 2-amino-6-methylpyrimidine, 2-amino-4,6-dimethylpyrimidine และใช้ในการผลิต sulfadiazine, sulfamethazine, sulfamethazine และยา sulfa อื่น ๆ ระดับกลาง
2.
กวานิดีน ไฮโดรคลอไรด์(หรือ guanidine nitrate) ทำปฏิกิริยากับ ethyl cyanoacetate เพื่อสร้าง 2,4-diamino-6-hydroxypyrimidine ซึ่งใช้ในการสังเคราะห์กรดโฟลิกต่อต้านโรคโลหิตจาง นอกจากนี้ยังสามารถใช้เป็นสารป้องกันไฟฟ้าสถิตย์สำหรับเส้นใยสังเคราะห์
3. มันยังสามารถใช้เป็นโปรตีน denaturant
4. เป็น denaturant ที่แข็งแกร่งในการทดลองสกัด RNA ทั้งหมดออกจากเซลล์ NS
กวานิดีน ไฮโดรคลอไรด์สารละลายสามารถละลายโปรตีน นำไปสู่การทำลายโครงสร้างเซลล์ การทำลายโครงสร้างรองของโปรตีนนิวเคลียร์ และการแยกตัวออกจากกรดนิวคลีอิก นอกจากนี้ RNase สามารถปิดใช้งานได้โดยตัวรีดิวซ์เช่น
กวานิดีน ไฮโดรคลอไรด์.